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收到案件编号短信并不意味着案件已经在检察院。案件编号短信通常是在案件被正式立案后，由法院或公安机关发出的通知，告知案件已经受理并分配了一个唯一的案件编号。因此，短信通知更多的是与法院或公安机关有关。

在某些情况下，检察院也可能参与案件的某些阶段，例如审查起诉阶段，如果您确实涉及到某个案件并被要求提供信息或出庭等，建议您按照短信中的指示及时与相关部门联系并了解情况。

仅凭收到案件编号短信不能确定案件是否在检察院，建议您及时与相关部门联系以获取更详细的信息。